可以使用 SSH（安全外壳协议）在 GitHub 上的存储库中访问和写入数据。 通过 SSH 进行连接时，使用本地计算机上的私钥文件进行身份验证。 有关 SSH 的详细信息，请参阅 Wikipedia 上的安全外壳。
设置 SSH 时，需要生成新的 SSH 私钥并将其添加到 SSH 代理中。 使用密钥进行身份验证或对提交进行签名之前，还必须将 SSH 公钥添加到 GitHub Enterprise Server 上的帐户中。 有关详细信息，请参阅“生成新的 SSH 密钥并将其添加到 ssh-agent”、“新增 SSH 密钥到 GitHub 帐户”和“关于提交签名验证”。
您可以使用硬件安全密钥来进一步保护 SSH 密钥，当密钥对用于通过 SSH 进行身份验证时，需要将物理硬件安全密钥附加到计算机上。 您还可以通过将密钥添加到 ssh 代理并使用密码来保护您的 SSH 密钥。 有关详细信息，请参阅“使用 SSH 密钥密码”。
为了保持帐户安全，您可以定期检查您的 SSH 密钥列表，并撤销任何无效或已泄漏的密钥。 有关详细信息，请参阅“审查 SSH 密钥”。
使用 GitHub Enterprise Cloud 的组织可以提供 SSH 证书，成员可以使用该证书访问组织的存储库，而无需将其添加到他们在 GitHub 上的帐户。