Erro: número de arquivo inadequado
Este erro normalmente significa que você não conseguiu se conectar ao servidor. Quase sempre isso é causado por firewalls e servidores proxy.
Ao executar SSH ou comandos do Git remotos, o tempo limite da conexão pode expirar:
$ ssh -vT git@hostname
> OpenSSH_5.8p1, OpenSSL 1.0.0d 8 Feb 2011
> debug1: Connecting to hostname [207.97.227.239] port 22.
> debug1: connect to address 207.97.227.239 port 22: Connection timed out
> ssh: connect to host hostname port 22: Connection timed out
> ssh: connect to host hostname port 22: Bad file number
Resolver o problema
Usar HTTPS
Geralmente, a solução mais simples é simplesmente evitar SSH por completo. A maioria dos firewalls e proxies permite tráfego HTTPS sem problemas. Para aproveitar isso, altere a URL remota que você está usando:
$ git clone https://hostname/username/reponame.git
> Cloning into 'reponame'...
> remote: Counting objects: 84, done.
> remote: Compressing objects: 100% (45/45), done.
> remote: Total 84 (delta 43), reused 78 (delta 37)
> Unpacking objects: 100% (84/84), done.
Testar em outra rede
Se você conectar o computador a outra rede que não tem firewall, conseguirá testar sua conexão SSH com o GitHub Enterprise. Se tudo funcionar como deveria, entre em contato o administrador de rede para saber como alterar as configurações de firewall e conseguir estabelecer conexão SSH com o GitHub Enterprise.